公司不一定能辞退流产员工，如果职员处于产假期间，那么单位不得将其辞退，否则需要支付经济赔偿金。根据现行法的规定，女职工怀孕未满、满4个月流产的，分别可以休15天、42天的产假。
公司不一定能辞退流产员工，因流产处于产假期间的职员是不能被辞退的。
1、女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天;难产的，应增加产假15天;生育多胞胎的，每多生育1个婴儿，可增加产假15天。
女职工怀孕未满4个月流产的，享受15天产假;怀孕满4个月流产的，享受42天产假。
2、如果单位辞退了以下法定不能被辞退的职员，则需要支付经济赔偿金：劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依照规定解除劳动合同：
(1)从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人在诊断或者医学观察期间的;
(2)在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的;
(3)患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的;
(4)女职工在孕期、产期、哺乳期的;
(5)在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的;
(6)法律、行政法规规定的其他情形。
流产的医疗费用可能由单位支付、也可能有由生育保险基金支付。女职工产假期间的生育津贴，对已经参加生育保险的，按照用人单位上年度职工月平均工资的标准由生育保险基金支付;对未参加生育保险的，按照女职工产假前工资的标准由用人单位支付。
女职工生育或者流产的医疗费用，按照生育保险规定的项目和标准，对已经参加生育保险的，由生育保险基金支付;对未参加生育保险的，由用人单位支付。
根据现行法的规定，若女性职员的怀孕行为并没有违反计划生育相关法律的规定，那么职员即使在怀孕期间流产，也是可以向单位提出请假请求的。单位在核实确有流产事实，且职员满足请假条件，一般会批准假期，在请假期间单位不得将职员辞退。
在我国的劳动者与用人单位的关系解除的规定中，如果是用人单位辞退劳动者的，此时是需要支付一定金额的补偿金的，但是经济不常见必须是用人单位违法辞退劳动者的，劳动者才能够主张的，包括在孕期予以辞退员工等。